Dr. Genius - .
FreeGIS - Insieme di pacchetti software per l'acquisizione di dati geografici.
Ghemical - Programma per creare graficamente molecole.
Goctave - Interfaccia grafica per Octave per GNOME.
Grace - Rappresentazione ed elaborazione di dati BI-dimensionali. Ottima interfaccia grafica, fa di tutto istogrammi, derivate, integrali, autocorrelazione, regressione, FFT,.... pero' solo per dati a DUE dimensioni .
Octave - Clone di MatLab.
Predict - Programma scientifico per il calcolo dell'orbita dei satelliti.
SAL - Scientific application for Linux, sito con link a programmi scientifici per il pinguino.
Scilab - Software scientifico simile a MatLab.
The Remote Microscope - Software scientifico.
Xppaut - Pacchetto completo (anche se graficamente "bruttino") per la risoluzione di Eq. differenziali ordinarie.